Cyber Safe凝胶电泳染料
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Cyber Safe DNA 凝胶电泳染料 是一种用于观测DNA琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶新一代染料,其使用特殊的合成工艺,与传统的溴乙锭(EB) 染料相比具有更高的灵敏度,且几乎没有致突变性,是最新的EB替代染。Cyber Safe凝胶电泳染料与DNA结合后,可使用紫外-可见分光光度计或激光光源的设备观测。此染料也可用于RNA 凝胶染色。Cyber Safe DNA凝胶电泳染料在280nm 和502nm有最大激发波长,与DNA结合后的最大发射波长是530nm。
实验方案
1.电泳后染色
1.1按常规方法制备琼脂糖凝胶,胶中不能含任何其他染料。
1.2把保存于DMSO中的10000X Cyber Safe DNA凝胶电泳染料用TAE或TBE 缓冲液按1:10000稀释成1X Cyber Safe DNA 凝胶电泳染料(比如把10 μL Cyber Safe 用 TAE or TBE 缓冲液稀释到100mL).
1.3染色: 用塑料容器装适量 1X Cyber Safe 染色液,染色液淹没凝胶即可。一般情况下,50mL染色液足以满足常规的小块凝胶,对于较大的凝胶,适量增加染色液用量,确保整块凝胶浸入液面下.
注意:染色容器不要使用玻璃器皿,因为染料会吸附在玻璃器皿的内壁,影响色效果。
1.4浸泡的凝胶室温下放置30分钟 (染色时间因凝胶浓度和厚度而定),用铝箔盖住容器或置于暗室避光,轻微摇动染色容器(50rpm),不需脱色处理。
1.5在254 nm紫外照射透视下,与双链DNA结合的Cyber Safe呈现绿色荧光。拍照时最好使用绿色滤光片。也可使用300 nm紫外照射透视仪或蓝光透照仪观察。
2.电泳中染色 (仅适于琼脂糖凝胶电泳)
2.1直接用1X Cyber Safe DNA凝胶电泳染料(见1.2)与适量琼脂糖粉末配制凝胶。例如, 要配制25ml熔融的琼脂糖凝胶,可直接在 25ml 1X Cyber Safe中加入适量琼脂糖粉末,摇匀加热。
注意:预制含 Cyber Safe 的凝胶,与配制EB凝胶一样需微波炉加热,结合了Cyber Safe的DNA片段电泳时会比未结合染料的DNA片段走的稍慢,这也与EB染料的情况一样。
2.2电泳: 按常规操作, 电泳后不需要染色或脱色.
2.3在254 nm紫外照射透视下,与双链DNA接合的Cyber Safe呈现绿色荧光。拍照时最好使用绿色滤光片。也可使用300 nm紫外照射透视仪观察。