Cyber Green核酸凝胶染料
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Cyber Green 染料是一种绿色荧光核酸染料,可用于qPCR,解链曲线分析,嗜热解旋酶依赖性扩增(tHDA)的实时监测,常规溶液DNA定量和各种凝胶电泳。 DNA结合的Cyber Green 染料的激发和发射光谱非常接近荧光素(FAM)或SYBR®Green,使染料与配备488 nm氩激光的仪器或任何波长区域的可见光激发兼容。 Cyber Green 染料在热和水解方面都非常稳定,在日常处理过程中提供了便利。染料本身基本上是非荧光的,但在与dsDNA结合后变得高度荧光。荧光强度至少比溴化乙锭高一个数量级。此外,DNA / Cyber Green 复合物的荧光量子产率比DNA /溴化乙锭的荧光量子产率高5倍以上。它可以在电泳(预染色)之前,以及在电泳(后染色)之后使用,并且通过毛细管电泳分离染色DNA。它也常用于分子生物学,不含酶(例如:Taq酶,逆转录酶,内切核酸酶,T4连接酶)抑制,并且不干扰Southern blot(Southern印迹杂交)。
染料特点
高灵敏: 至少可检出20pg DNA,高于EB染色法25-100倍
信噪比高:样品荧光信号强,背景信号低
操作简单:无须脱色或冲洗
适用范围广:可适用于多种电泳分析
使用方便:不影响其它修饰酶作用
经济:价格便宜
染色方案
我们发现通过后染色实现了最大的灵敏度,这也消除了染料干扰DNA迁移的可能性。虽然预制方案更方便,但一些DNA样本可能会出现迁移,强烈建议凝胶运行时间不超过2小时。建议使用以下方案。 可能需要进行一些比较以确定哪一个更符合您的需求。
1.后染色方案
1.1根据您的标准方案运行凝胶。
1.2通过将10,000X储备试剂稀释到PH 7.5 - 8缓冲液中制备1X Cyber Green 工作溶液(例如,TAE,TBE或TE优选pH8.0)。
注意:在水中制备的染色溶液不如在缓冲液中制备的染色溶液稳定,必须在24小时内使用,以确保最大的染色灵敏度。另外,在pH低于约7.5或高于8.0的缓冲液中制备的染色溶液不太稳定并且显示出降低的染色效力。
1.3将凝胶放入合适的聚丙烯容器中。轻轻加入足量的1X染色溶液浸没凝胶。
注意:不要使用玻璃容器,因为它会吸附染色溶液中的大部分染料。
1.4在室温下轻轻搅拌凝胶约30分钟,避光。
注意:染色溶液可以在黑暗中储存(最好是冷藏)一周,最多重复使用2-3次。
1.5使用254 nm透射仪或使用长路绿色滤光片(如SYBR®滤光片或GelStar®滤光片)的激光凝胶扫描仪对染色的凝胶成像。
2.预染色方案
2.1使用标准方案制备琼脂糖凝胶溶液。
2.2在浇注凝胶前将10,000X Cyber Green™原液试剂以1:10,000稀释到凝胶溶液中并充分混合。
2.3根据您的标准方案运行凝胶。
2.4使用254 nm透射仪或使用长路径绿色滤光片(如SYBR®滤光片或GelStar®滤光片)的激光凝胶扫描仪对染色的凝胶成像。
3.电泳前的DNA染色
3.1在电泳前,用1:10,000稀释的染料(TE,TBE或TAE)孵育DNA至少15分钟。
3.2根据您的标准方案运行凝胶。
3.3使用254 nm透射仪或使用长路绿色滤光片(如SYBR®滤光片或GelStar®滤光片)的激光凝胶扫描仪对染色的凝胶成像。